Предлагаемые наборы предназначены для выделения циркулирующей нуклеиновой кислоты (ДНК и РНК) из образцов плазмы или сыворотки. ДНК и РНК существуют в плазме в разных формах: в свободной форме (в очень незначительном количестве), в экзосомах и других внеклеточных везикулах (преимущественно), а также в комплексе с белками и другими макромолекулами. Все наборы для выделения ДНК / РНК с помощью частиц SileksMagNA или SileksMagNA-Direct подходят для выделения всех нуклеиновых кислот находящихся в образце. Наборы могут использоваться для выделения вирусной РНК и ДНК, ДНК, РНК и мРНК, микроРНК (выделение с помощью частиц SileksMagNA-Direct), частично разрушенной или сильно деградированной нуклеиновой кислоты. |
SileksMagNA vs SileksMagNA-Direct
При выборе оптимального набора для выделения нуклеиновых кислот из плазмы и/или сыворотки нужно определиться с тем, какой тип нуклеиновой кислоты планируется выделять и как выделенная кислота будет использоваться далее.
1. Тип нуклеиновой кислоты. ДНК или РНК.
При выделении РНК для последующего анализа как правило требуется проведение реакции синтеза первой цепи (обратная транскрипция). При проведении именно этой реакции большое значение имеют примеси, полученные при выделении РНК.
При выделении на силикатных частицах любых производителей полностью избавиться от сопутствующих примесей невозможно. Силикатные частицы и прилагаемая система выделения каждого конкретного производителя будут давать те или иные примеси, которые будут влиять на эффективность проведения реакции синтеза первой цепи (обратная транскрипция), что скажется на результатах дальнейшего анализа.
Применение частиц SileksMagNA-Direct для выделения РНК имеет в данном случае однозначное преимущество. Это связано с особенностью связывания РНК на поверхности частиц и последующей десорбцией. В ходе этих процедур РНК выделяется максимально чистой, не содержащей посторонних примесей. Чувствительность при анализе выделенной РНК имеет максимальное значение по сравнению с другими наборами.
Наши рекомендации для выделения РНК из плазмы/сыворотки - SileksMagNA-Direct.
При выделении ДНК для последующего анализа как правило используют полимеразную цепную реакцию (ПЦР). ПЦР и участвующие в нем ферменты менее чувствительны к посторонним примесям. Поэтому эффективность выявления ДНК в меньшей степени зависит от чистоты выделения.
Наши рекомендации для выделения ДНК из плазмы/сыворотки - SileksMagNA или SileksMagNA-Direct.
Нужно принять во внимание планы на дальнейшее использование и размер выделяемой нуклеиновой кислоты.
2. Дальнейшее использование.
SileksMagNA-Direct
Выделенную РНК и ДНК рекомендуется использовать сразу после выделения. Хранение более 24 часов (даже при глубоком замораживании) не рекомендуется.
SileksMagNA
Выделенную РНК рекомендуется использовать сразу после выделения. Хранение более 24 часов (даже при глубоком замораживании) не рекомендуется.
Выделенную ДНК рекомендуется использовать сразу после выделения. Возможно хранение при глубоком замораживании.
3. Размер выделяемой нуклеиновой кислоты.
SileksMagNA-Direct
Одинаково эффективно выделяются одно- и двухцепочечные нуклеиновые кислоты, РНК и ДНК, от 1-3 нуклеотидов до несколько тысяч нуклеотидов. Возможно выделение микро РНК.
SileksMagNA
Эффективно выделяются одно- и двухцепочечные нуклеиновые кислоты, РНК и ДНК, от 40-50 нуклеотидов до несколько тысяч нуклеотидов. Преимущество при сорбции имеют двухцепочечные нуклеиновые кислоты.